Задачей федерального проекта «Сохранение озера Байкал» является сохранение самого глубокого и крупнейшего в мире озера по объему пресной воды, признанного объектом Всемирного наследия ЮНЕСКО. Проект содержит систему взаимосвязанных мероприятий, цель которых заключается в улучшении экологического состояния Байкала за счет сокращения объема загрязненных стоков в озеро и другие водоемы Байкальской природной территории, а также за счет очистки загрязненных объектов.